Contamination Croisée/Transfert Analytique - Qiagen therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit Mode D'emploi

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p.Y373C (c.1118A>G), FGFR3-TACC3v3, FGFR3-BAIA2PL1, FGFR2-BICC1 et FGFR2-
CASP7 ont été préparés à un niveau de concentration de 3 x la LoD et testés à l'aide de
trois lots de therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit. Tous les échantillons ont été normalisés et
dilués à un niveau de concentration de 3 x la LoD pour chaque dosage. Au total,
36 réplicats ont été préparés pour chaque échantillon. Le pourcentage global de détections
correctes pour tous les échantillons pour tous les lots de therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit et
de RNeasy DSP FFPE Kit était de 99,65 % (286 échantillons/287).
Contamination croisée/transfert analytique
L'objectif de cette étude était d'évaluer le therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit en termes de
transfert quand des échantillons positifs à des niveaux élevés d'altérations de FGFR sont
testés à côté d'échantillons négatifs. Cette étude a examiné l'ensemble du FGFR System, de
l'extraction à l'amplification par PCR, et cherché à déterminer si un transfert se produit entre
les échantillons, entre les extractions et au sein ou entre les cycles.
Les échantillons FFPE de CU cliniques ont été divisés en deux groupes indépendants. Les
deux groupes comprenaient 18 échantillons de type sauvage et 12 échantillons positifs aux
altérations de FGFR. La préparation de l'extraction de l'ARN, de la RT et de la PCR a été
effectuée en fonction d'une matrice conçue pour introduire le risque de contamination
croisée entre les échantillons. Chaque groupe a été testé par un opérateur différent à l'aide
du même lot de therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit. Au total, 128 réplicats de type sauvage
ont été testés et le pourcentage de faux positifs pour les échantillons de type sauvage était
de 3,13 % (4 échantillons/128).
Mode d'emploi (manuel) du therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit 08/2019
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