Manipulation Des Prélèvements; Interchangeabilité Des Lots - Qiagen therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit Mode D'emploi

Manipulation des prélèvements
Cette étude a évalué la variabilité dans la manipulation des échantillons, en particulier au
cours de l'étape d'extraction de l'ARN. Les prélèvements cliniques de CU FFPE ont été
divisés en trois groupes indépendants pour l'extraction avec le RNeasy DSP FFPE Kit dans
trois laboratoires indépendants. Chaque groupe contenait un nombre prédéfini de
prélèvements avec FGFR de type sauvage et de prélèvements positifs aux altérations de
FGFR [c'est-à-dire « FGFR Alteration Detected » (Altération de FGFR détectée)]. Tous les
prélèvements ont été anonymisés avant l'extraction pour être traités en aveugle. Chaque
groupe a été extrait trois fois par deux opérateurs sur trois sites. Tous les échantillons d'ARN
ont ensuite été testés à l'aide du therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit sur un site.
Pour toutes les altérations de FGFR, la proportion de détections correctes était de 96,22 %,
confirmant la reproductibilité et la répétabilité du therascreen FGFR RGQ RT-PCR System à
l'étape préanalytique d'isolement de l'ARN.
Interchangeabilité des lots
Cette étude a évalué l'impact potentiel de la variabilité entre les lots sur la détection des
altérations de FGFR par le therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit. Le FGFR System fait appel à
deux kits distincts : le RNeasy DSP FFPE Kit pour l'isolement de l'ARN à partir des
prélèvements cliniques de CU FFPE et le therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit pour
l'amplification et la détection des altérations de FGFR.
L'interchangeabilité des lots a été démontrée à l'aide de trois lots de RNeasy DSP FFPE Kit et
de trois lots de therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit. Une combinaison d'échantillons cliniques
et artificiels a été utilisée pour cette étude. Quatre prélèvements cliniques FFPE présentant les
altérations p.R248C (c.742C>T), p.S249C (c.746C>G) et FGFR3-TACC3v1 ainsi qu'un
prélèvement clinique FFPE de type sauvage ont été extraits en duplicats à l'aide de trois lots
de RNeasy DSP FFPE Kit et testés avec trois lots différents de therascreen FGFR RGQ RT-
PCR Kit. De plus, des échantillons artificiels pour les altérations p.G370C (c.1108G>T),
59 Mode d'emploi (manuel) du therascreen FGFR RGQ RT-PCR Kit 08/2019