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Analyse de fusion haute résolution
l'ADNsb mais s'intercale activement avec l'ADNdb et devient
très fluorescent une fois intercalé. Vous pouvez utiliser la
variation de fluorescence pour mesurer l'augmentation de la
concentration en ADN au cours de la PCR puis pour mesurer
directement la fusion thermique de l'ADN par HRM. Au cours
de la HRM, la fluorescence est élevée au début parce que
l'échantillon
fluorescence diminue avec l'augmentation de la température
et l'ADN se divise en brins individuels. Le comportement de
fusion observé est caractéristique d'un échantillon d'ADN
particulier.
Avec la HRM, le Rotor-Gene Q MDx peut caractériser des
échantillons d'après la longueur de la séquence, le taux de
GC et la complémentarité de la séquence d'ADN. La HRM
peut être utilisée dans les applications de génotypage, comme
l'analyse des insertions/délétions ou les polymorphismes
mononucléotidiques (Single nucleotide polymorphism, SNP),
ou pour rechercher des mutations génétiques inconnues. Elle
peut aussi être utilisée dans les applications épigénétiques
pour la détection et l'analyse du statut de méthylation de
l'ADN. Elle peut également permettre la détection quantitative
d'une petite partie du variant d'ADN dans un bruit de fond de
séquence de type sauvage à des sensibilités proches de 5 %.
Cela peut être utile, par exemple, pour étudier les mutations
somatiques acquises ou les variations du statut de méthylation
des îlots CpG.
La HRM sur le Rotor-Gene Q MDx facilite de multiples
applications, notamment :
11-2
Manuel d'utilisation du Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM (CA) 05/2018
commence
Identification de gènes candidats de prédisposition
Études d'association (comparant des cas et des contrôles,
un génotype et un phénotype)
Détermination de la prévalence allélique dans une
population ou un sous-groupe
Dépistage et validation des SNP
Dépistage de la perte d'hétérozygosité
Identification génétique
Caractérisation des blocs haplotypiques
Analyse de méthylation de l'ADN
Cartographie génétique
en
tant
qu'ADNdb.
Puis
la
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