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7.6.3
Deux courbes étalons
Vous pouvez réaliser une analyse de l'expression génétique
relative à l'aide d'un gène de normalisation grâce à la
méthode à 2 courbes étalons.
Cette méthode nécessite une courbe étalon pour chaque
gène. La concentration pour chaque gène est quantifiée selon
sa courbe étalon. L'expression du gène d'intérêt est ensuite
normalisée avec le gène de normalisation (souvent un gène
domestique).
Il est important de définir correctement les échantillons étalons
et les réplicats au cours de la configuration des échantillons
(voir la section 6.1.4). Il faut tout particulièrement que les
échantillons correspondants aient le même nom dans chaque
analyse. Dans une réaction multiplexe, dans laquelle les
positions de tube du gène d'intérêt et du gène de
normalisation sont identiques, une série de définitions des
échantillons suffit. Si vous effectuez une analyse relative avec
un gène de normalisation dans un seul canal (c.-à-d. les
réactions sont analysées dans des tubes distincts utilisant le
même fluorophore), vous devez créer 2 pages d'échantillons.
La première doit indiquer les positions de tube avec les noms
des échantillons pour le gène d'intérêt et les autres positions
doivent rester sans nom. La deuxième doit indiquer les
positions utilisées pour le gène de normalisation. Le logiciel
fait ensuite correspondre les échantillons sur les 2 analyses
d'après leurs noms.
Analyse de l'expression avec la méthode à deux
courbes étalons
Vous pouvez commencer par analyser les données pour
chaque gène avec l'analyse de quantification. Autrement, les
résultats
automatiquement à l'aide de l'outil « Autofind Threshold »
(Recherche automatique du seuil).
Manuel d'utilisation du Rotor-Gene Q MDx 5plex HRM (CA) 05/2018
Interface utilisateur d'analyse
pour
chaque
gène
seront
déterminés
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