Qiagen Rotor-Gene Q MDx CE Manuel D'utilisation page 98

Remarque : si une valeur est exclue par l'activation de l'une de ces techniques, la valeur C
T
correspondante n'apparaîtra pas dans la fenêtre Quantitation Results (Résultats de la quantification).
Un indicateur de l'exclusion apparaîtra au même moment dans la colonne « Ct Comment »
(Commentaire Ct). Il est donc important de laisser toujours la colonne « Ct Comment »
(Commentaire Ct) affichée.
Sur l'image ci-dessous, les échantillons 7, 8 et 9 ont été exclus pour cause de « Reaction Efficiency
Threshold » (Seuil d'efficacité de la réaction).
Pente, amplification, efficacité de la réaction
La pente (M) d'une réaction (affichée dans la fenêtre Standard Curve [Courbe étalon]) peut être utilisée
pour déterminer l'amplification exponentielle et l'efficacité de la réaction à l'aide des calculs suivants :
Amplification exponentielle = 10
(–1/M)
Efficacité de la réaction = [10 ] – 1
(–1/M)
Les valeurs optimales pour la pente M, l'amplification exponentielle et l'efficacité de la réaction
sont respectivement –3,322, 2 et 1. L'efficacité de la réaction apparaît sur le rapport (sur les
rapports complets et standard, voir page 85) et dans la fenêtre Standard Curve (Courbe étalon).
La pente est calculée comme le changement de la valeur C divisé par le changement d'entrée log
T
(p. ex. nombre de copies). Une amplification 100 % efficace signifie un doublement du produit
d'amplification à chaque cycle, ce qui donne une valeur de M de –3,322, un facteur
d'amplification de 2 et une efficacité de la réaction de 1.
Avec une valeur de M de –3,322, les calculs sont les suivants :
Amplification exponentielle : 10 (–1/–3,322) = 2
Efficacité de la réaction : [10 ] – 1 = 1
(–1/–3,322)
Autre exemple : une valeur de M de 3,8 signifie que la réaction présente une amplification
exponentielle d'environ 1,83 et une efficacité de la réaction de 0,83 (ou 83 %).
Manuel d'utilisation du Rotor Gene Q MDx CE 02/2022 98