Qiagen Rotor-Gene Q MDx CE Manuel D'utilisation page 97

Le NTC Threshold (Seuil du contrôle sans matrice) est recommandé pour la plupart des applications.
L'approche utilisée doit être validée.
NTC Threshold Permet d'exclure de l'analyse les échantillons ou les contrôles sans matrice qui
(Seuil du contrôle sans matrice) :
présentent une légère déviation vers le haut. Les échantillons présentant un
changement inférieur au « NTC Threshold » (Seuil du contrôle sans matrice) ne
sont pas rapportés et un indicateur « NEG (NTC) » apparaît dans la colonne
« CT Comment » (Commentaire CT).
Le pourcentage est relatif au changement maximal observé dans un tube. Par
exemple, si un échantillon a commencé à un bruit de fond de 2 Fl avant de
passer à 47 Fl, alors 45 Fl représente 100 %. Un « NTC Threshold » (Seuil du
contrôle sans matrice) de 10 % considérera tout échantillon inférieur à 4,5 Fl
comme un bruit.
Reaction Efficiency Threshold Le « Reaction Efficiency Threshold » (Seuil d'efficacité de la réaction) est une
(Seuil d'efficacité de la autre méthode permettant d'exclure le bruit de l'analyse. Cet algorithme de
réaction) :
normalisation utilise les techniques d'estimation de l'efficacité de la réaction
utilisées dans la quantification comparative (consultez la section 6.6.6). Tous
les échantillons qui ne présentent pas une efficacité de la réaction au moins
égale à ce niveau sont exclus et un indicateur « NEG (R.Eff) » apparaît dans
la colonne « CT Comment » (Commentaire CT).
Un niveau de 0 % indique que, au cours de la phase exponentielle, aucune réaction
n'a eu lieu. 100 % indique qu'une réaction d'une efficacité totale a eu lieu au cours
de la phase exponentielle. Des pourcentages négatifs indiquent que, au cours de la
phase exponentielle, le signal de fluorescence a décliné.
Les recherches actuelles ne sont pas concluantes sur les niveaux précis d'efficacité
requis pour distinguer les véritables réactions d'une contamination et d'autres effets.
Pour cette raison, nous recommandons d'utiliser cette fonctionnalité avec prudence,
en partant du principe que tout échantillon avec une véritable réaction présentera
une phase exponentielle visible avec une certaine augmentation de la fluorescence.
En définissant cette valeur à plus de 0 %, vous exclurez certains échantillons
présentant une augmentation inefficace, mais perceptible dans la fluorescence,
tandis qu'en la définissant à moins de 0 %, vous afficherez des échantillons qui ont
présenté une diminution dans la fluorescence au cours de la phase exponentielle et
qui doivent donc clairement être exclus.
Manuel d'utilisation du Rotor Gene Q MDx CE 02/2022 97