Table des Matières
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Glossaire
Terme
Amorce de
séquençage
AQ
Billes de
Sepharose
Biotine
Bisulfite
Chute
CpG
Décalage
Manuel d'utilisation du PyroMark Q24 MDx 01/2016
Description
L'amorce de séquençage est hybridée avec la matrice
pendant la préparation des échantillons. L'extrémité 3'
de l'amorce de séquençage sert de point de départ
pour l'élongation par l'ADN polymérase.
Mode d'analyse utilisé pour la quantification de
différents allèles.
Il convient d'utiliser des billes recouvertes de
streptavidine pour la préparation des produits de PCR
biotinylés.
Molécule capable de se lier très fortement à la
streptavidine. Il est possible de biotinyler les amorces
de PCR afin que le produit de PCR obtenu se lie aux
billes recouvertes de streptavidine.
HSO
-
est appelé bisulfite (ou hydrogénosulfite). L'ADN
3
est traité par le bisulfite de sodium afin de transformer
la cytosine résiduelle en uracile dans des conditions
telles que les cytosines méthylées restent non réactives.
Diminution continue de la hauteur de pic normalement
observée sur le pyrogramme.
Mode d'analyse de la méthylation des dinucléotides
CpG.
Décalage positif : Faible proportion de séquences de la
matrice qui intègrent plus d'un type de nucléotide à la
fois (par exemple, en cas de présence de résidus de la
distribution précédente) et qui se trouvent avant les
autres séquences de la matrice.
Décalage négatif : Faible proportion de séquences de
la matrice qui n'ont pas intégrer un nucléotide et se
trouvent après les autres séquences de la matrice.
Glossaire
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