illumina iSeq 100 Manuel Système page 56

Guide du système de séquençage iSeq 100
Assurez-vous qu'au moins une des séquences d'adaptateurs d'index du regroupement de librairies ne
débute pas avec deux bases G. Sélectionnez des séquences d'adaptateurs d'index équilibrées de façon à
ce que le signal soit présent sur au moins une image (préférablement sur les deux) pour chaque cycle. La
disposition de la plaque et les séquences fournies avec IDT pour les index TruSeq UD pour Illumina sont
conçues pour procurer le bon équilibre.
Pour plus de renseignements sur l'indexage et le regroupement, consultez le guide de regroupement des
adaptateurs d'index (document nº 1000000041074).
Notation de la qualité
Un score de qualité permet de prédire la probabilité d'une erreur dans la définition des bases. Un score de
qualité plus élevé implique qu'une définition des bases est de plus haute qualité et plus susceptible d'être
correcte.
Le score de qualité est un moyen simple d'indiquer la probabilité de petites erreurs. Q(X) représente les
scores de qualité, où X est le score. Le tableau suivant montre la relation entre le score de qualité et la
probabilité d'une erreur.
Score de qualité
Probabilité d'une erreur
Q(X)
Q40 0,0001 (1 sur 10 000)
Q30 0,001 (1 sur 1 000)
Q20 0,01 (1 sur 100)
Q10 0,1 (1 sur 10)
REMARQUE
La notation de la qualité s'appuie sur une version modifiée de l'algorithme Phred.
La notation de la qualité calcule un ensemble d'indicateurs prévisionnels pour chaque définition des bases,
puis utilise ces valeurs pour rechercher un score de qualité dans un tableau de qualité. Les tableaux de
qualité servent à fournir des indicateurs de qualité extrêmement précis pour des analyses générées par une
configuration spécifique de plateforme de séquençage et de version de chimie.
Une fois le score de qualité établi, les résultats sont enregistrés dans les fichiers de définition des bases.
Document nº 1000000036024 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
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