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Guide de référence de
l'instrument MiSeqDx
avec MOS v2
DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT
EXCLUSIF À ILLUMINA
Document nº 1000000021961 v03 FRA
Avril 2020
MD

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Sommaire des Matières pour illumina MiSeqDx

  • Page 1 Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2 DESTINÉ AU DIAGNOSTIC IN VITRO UNIQUEMENT EXCLUSIF À ILLUMINA Document nº 1000000021961 v03 FRA Avril 2020...
  • Page 2 Ce logiciel contient la librairie SeqAn, dont la licence est détenue par Illumina, et qui est distribuée sous la licence suivante : Copyright © 2010, Knut Reinert, FU Berlin, Tous droits réservés. La redistribution et l’utilisation au format source ou sous forme binaire, avec ou sans modification, sont autorisées pourvu que les conditions suivantes soient réunies :...
  • Page 3: Historique Des Révisions

    Ajout de renseignements sur le service de surveillance Mars 2018 Illumina Proactive dans une nouvelle section intitulée Set Send Instrument Health (Programmer l’option Transmettre l’état de l’instrument). 1000000021961 v00 Publication originale. Novembre  2015 Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 4 [Diese Seite wurde absichtlich leer gelassen.] Document  nº 1000000021961 v03  FRA...
  • Page 5: Table Des Matières

    Relever manuellement les dispositifs d’aspiration de la cartouche de réactifs Résolution des erreurs de configuration de lʼanalyse Résolution des échecs de lecture RFID Prévention des redémarrages lors d’une analyse Dépannage en cas d’erreur de débit Réalisation d’un test de volume Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 6 Résolution des erreurs liées à la température du réfrigérant pour réactifs Résolution des erreurs d’analyse de Local Run Manager Configuration des paramètres du système Annexe B Dossiers de sortie Dossiers d’analyse Index Assistance technique Document  nº 1000000021961 v03  FRA...
  • Page 7: Chapitre 1 Vue D'ensemble

     Chapitre 1 Vue d’ensemble Vue d’ensemble Composants Logiciels MiSeqDx Logiciel Local Run Manager Espace disque requis Logiciel antivirus Mode recherche Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 8: Composants

    Compartiment des réactifs : contient les réactifs à la bonne température, les solutions de lavage et le flacon à déchets. Un verrou magnétique sécurise la porte du compartiment des réactifs. L’interface MiSeqDx guide les utilisateurs tout au long du processus de configuration de lʼanalyse grâce à lʼécran de surveillance tactile. Document  nº 1000000021961 v03  FRA...
  • Page 9 Zone d’imagerie Port d’entrée La Flow Cell MiSeqDx est un substrat de verre à usage unique qui sert de support à la génération des amplifiats et à la réaction de séquençage. Les réactifs pénètrent dans la Flow Cell par le port d’entrée, traversent la zone d’imagerie de la ligne unique, puis sortent par le port de sortie.
  • Page 10 À droite du réfrigérant pour réactifs se trouvent deux emplacements expressément prévus pour le flacon de solution SBS MiSeqDx (PR2) et le flacon à déchets. La poignée des dispositifs dʼaspiration met les flacons en place et abaisse le dispositif dʼaspiration approprié...
  • Page 11: Logiciels Miseqdx

    De gauche à droite, les indicateurs d’activité représentent les activités suivantes : Déplacement de la platine Y Déplacement de la platine Z Activation de la fonctionnalité électronique Utilisation de la caméra Pompage par le système fluidique Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 12 Icônes d’état Le coin supérieur droit de l’écran d’accueil affiche une icône d’état qui indique toute modification des conditions pendant la configuration de l’analyse ou pendant l’analyse. Icône Nom de l’état Description d’état État OK Aucune modification. Le système est normal. Attention Renseignements importants.
  • Page 13: Logiciel Local Run Manager

    Les ressources informatiques de l’instrument MiSeqDx sont dédiées au séquençage ou à l’analyse. Si une nouvelle analyse de séquençage est lancée sur le système MiSeqDx avant la fin de l’analyse secondaire d’une analyse précédente, une boîte de dialogue de confirmation s’affiche.
  • Page 14: Espace Disque Requis

    Espace disque requis L’ordinateur de l’instrument dispose d’une capacité de stockage d’environ 550 Go. Avant le lancement d’une analyse, le logiciel vérifie l’espace disque disponible. Si l’espace disque n’est pas suffisant pour l’analyse, une invite du logiciel s’affiche. Le message indique le volume d’espace disque requis pour l’analyse et le volume à libérer avant l’exécution de l’analyse.
  • Page 15: Logiciel Antivirus

    Illumina recommande vivement l’installation d’un logiciel antivirus fourni par l’utilisateur afin de protéger l’ordinateur des virus. Pour éviter les interférences avec le fonctionnement de l’instrument MiSeqDx ou la perte de données, configurez le logiciel antivirus comme suit : Configurez des analyses manuelles (non automatisées).
  • Page 16: Mode Recherche

    Mode recherche Utilisez la commande Reboot to Research Mode (Redémarrer en mode recherche) pour faire passer le logiciel du système en mode recherche (RUO). L’utilisation de cette fonction nécessite soit le niveau d’accès administrateur soit l’autorisation de redémarrer en mode recherche, pour les autres utilisateurs.
  • Page 17: Chapitre 2 Pour Commencer

    Paramétrage de l’option de démarrage automatique de l’analyse Programmer l’option Send Instrument Health (Transmettre l’état de l’instrument) Paramétrage des préférences de courriel Paramétrage de l’emplacement du dossier de sortie par défaut Consommables requis Stockage et manipulation Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 18: Mise En Marche Du Miseqdx

    Attendez au moins 60  secondes avant de rallumer l’appareil. Si le système MiSeqDx n’est pas déjà sous tension, localisez le bouton d’alimentation, situé sur le côté droit du panneau arrière de l’instrument. Il se trouve dans le coin inférieur, juste au-dessus du cordon d’alimentation.
  • Page 19: Paramétrage De L'option De Lavage Après Analyse

    20 minutes. Le lavage de maintenance dure approximativement 90 minutes. À l’écran d’accueil, sélectionnez Run Options (Options d’analyse). Sélectionnez l’onglet Run Settings (Paramètres de l’analyse). Sélectionnez Post Run Wash (Lavage après analyse) ou Maintenance Wash (Lavage de maintenance). Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 20: Paramétrage De L'option De Démarrage Automatique De L'analyse

    Paramétrage de l’option de démarrage automatique de l’analyse À l’écran d’accueil, sélectionnez Run Options (Options d’analyse). Sélectionnez l’onglet Run Settings (Paramètres de l’analyse). Cochez la case Start run after pre-run check. Do not prompt for confirmation. (Lancer l’analyse après la vérification avant analyse. Ne pas demander de confirmation.) Lorsque ce paramètre est activé, l’analyse de séquençage démarre automatiquement une fois la vérification automatique correctement effectuée.
  • Page 21: Programmer L'option Send Instrument Health (Transmettre L'état De L'instrument)

    MOS utilisée. Lorsque ce paramètre est activé, les données relatives à la performance de l'instrument sont transmises à Illumina. Ces données facilitent le dépannage par Illumina et lui permettent de détecter les pannes potentielles, d’exécuter une maintenance proactive et d’optimiser le temps d’utilisation de l’instrument.
  • Page 22: Paramétrage Des Préférences De Courriel

    Paramétrage des préférences de courriel MiSeqDx peut être configuré pour envoyer une notification par courriel lorsque l’analyse RTA est terminée, lorsque l’analyse secondaire sur instrument est terminée ou si une erreur logicielle MiSeqDx critique se produit. Normalement, cette configuration se fait au moment de l’installation de l’instrument MiSeqDx.
  • Page 23: Paramétrage De L'emplacement Du Dossier De Sortie Par Défaut

    Paramétrage de l’emplacement du dossier de sortie par défaut Le dossier Output Folder (Dossier de sortie) de MiSeqDx définit l’emplacement où les fichiers de sortie des analyses sont placés par défaut. Les dossiers peuvent se trouver sur un réseau local ou sur l’ordinateur de l’instrument. Placez le dossier de sortie par défaut sur le réseau aux fins du partage ou de l’archivage à...
  • Page 24: Consommables Requis

    Consommables requis Consommables pour le séquençage Les consommables de séquençage nécessaires au fonctionnement de MiSeqDx sont fournis séparément dans une trousse de diagnostic in vitro. Consommables fournis par l’utilisateur Assurez-vous que les consommables suivants fournis par l’utilisateur sont disponibles avant de lancer une analyse.
  • Page 25: Chapitre 3 Séquençage

    Préparation de la cartouche de réactifs Se connecter et suivre les invites relatives au séquençage Nettoyage de la Flow Cell Chargement de la Flow Cell Chargement des réactifs Surveillance de l’analyse Réalisation d’un lavage après analyse Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 26: Introduction

    Introduction Pour exécuter une analyse sur le système MiSeqDx, suivez les étapes de configuration décrites dans ce chapitre. Après le lancement de l’analyse, aucune intervention supplémentaire de l’utilisateur n’est requise. Une fois l’analyse de séquençage terminée, effectuez un lavage de l’instrument.
  • Page 27: Durée De Lʼanalyse

    Durée de lʼanalyse La durée de l’analyse dépend du nombre de cycles réalisés. Selon la version des réactifs MiSeqDx, l’instrument MiSeqDx peut faire des analyses de séquençage à lectures appariées pouvant comporter jusqu’à 2 x 301 cycles de séquençage. Nombre de cycles d’une lecture Une lecture comprend un cycle de plus que le nombre de cycles analysés.
  • Page 28: Flux De Travail Miseqdx

    Suivez les invites du logiciel pour charger la Flow Cell. Suivez les indications du logiciel pour charger le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx. Vérifiez que le flacon à déchets est vide et chargez la cartouche de réactifs. Si vous le souhaitez, surveillez l’analyse à l’écran Sequencing (Séquençage).
  • Page 29 Vous pouvez surveiller l’analyse secondaire par le biais d’une connexion Internet depuis un autre ordinateur. Consultez le Guide de référence du logiciel Local Run Manager pour MiSeqDx (document nº 1000000011880). Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 30: Préparation De La Cartouche De Réactifs

    Tapotez doucement la cartouche sur la paillasse pour éliminer les bulles d’air dans les réactifs. REMARQUE Comme les tubes des dispositifs d’aspiration MiSeqDx descendent au fond de chaque réservoir pour aspirer les réactifs, il est important qu’il ne reste aucune bulle d’air dans les réservoirs.
  • Page 31 Si des bulles d’air sont présentes, tapotez légèrement la cartouche sur la paillasse pour les libérer. Figure 5 Chargement des librairies Passez directement à la configuration de l’analyse depuis l’interface MiSeq Operating Software (MOS). Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 32: Se Connecter Et Suivre Les Invites Relatives Au Séquençage

    Se connecter et suivre les invites relatives au séquençage À l’écran Home (Accueil), sélectionnez Sequence (Séquencer). Si l’écran de connexion s’ouvre, saisissez les identifiants d’utilisateur appropriés, puis sélectionnez Next (Suivant). Sélectionnez à nouveau Sequence (Séquencer) après vous être connecté. Sélectionnez une analyse dans la liste. [Facultatif] Sélectionnez Preview Samples (Aperçu des échantillons) pour voir la liste des échantillons de l’analyse.
  • Page 33: Nettoyage De La Flow Cell

    Flow Cell et la cartouche soigneusement à l’aide d’un chiffon non pelucheux destiné au nettoyage de lentilles. Séchez doucement la zone autour du joint et du verre en tapotant. Figure 8 Ports et joint de la Flow Cell Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 34 Nettoyez le verre de la Flow Cell à l’aide d’une lingette alcoolisée. Veillez à ne pas laisser dʼempreintes ou de marques sur le verre ni de peluches ou de fibres textiles. Évitez de nettoyer le joint de port de la Flow Cell avec une lingette alcoolisée. Figure 9 Séchage de la Flow Cell Séchez tout excès dʼalcool avec un chiffon non pelucheux destiné...
  • Page 35: Chargement De La Flow Cell

    Appuyez doucement sur le verrou pour le refermer sur la Flow Cell. Lorsque le verrou de Flow Cell s’enclenche, les broches d’alignement positionnent la Flow Cell. Un clic sonore indique que le verrou de la Flow Cell est verrouillé. Figure 12 Verrouillage de la Flow Cell Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 36 Cependant, le logiciel n’autorise la défaillance que d’un seul des trois composants munis d’une étiquette RFID (Flow Cell, cartouche de réactifs et solution SBS (PR2) MiSeqDx) par analyse de diagnostics in vitro. Pour plus de renseignements, consultez la section Résolution des échecs de lecture RFID, page 58.
  • Page 37: Chargement Des Réactifs

    Charger le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx et vérifier le flacon à déchets Retirez le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx de son lieu de stockage réfrigéré, maintenu entre 2 °C et 8 °C. Renversez pour mélanger, puis retirez le couvercle. Ouvrez la porte du compartiment de réactifs.
  • Page 38 Cependant, le logiciel n’autorise la défaillance que d’un seul des trois composants munis d’une étiquette RFID (Flow Cell, cartouche de réactifs et solution SBS (PR2) MiSeqDx) par analyse de diagnostics in vitro. Pour plus de renseignements, consultez la section Résolution des échecs de lecture RFID, page 58.
  • Page 39 Remarque importante avant le lancement de l’analyse AVERTISSEMENT L’instrument MiSeqDx est sensible aux vibrations. Tout contact avec l’instrument après le lancement de l’analyse peut avoir une incidence néfaste sur les résultats de séquençage. Après avoir chargé la cartouche de réactifs et fermé la porte du compartiment des réactifs, n’ouvrez pas les portes du compartiment de la Flow Cell ou du compartiment des réactifs et...
  • Page 40: Surveillance De L'analyse

    Surveillance de l’analyse Pendant l’analyse, surveillez la progression de l’analyse, les intensités et les scores de qualité à l’écran Sequencing (Séquençage). Lʼécran Sequencing (Séquençage) est en affichage seul. Run Progress (Progression de l’analyse) : indique la progression de l’analyse dans une barre d’état, ainsi que le nombre de cycles terminés.
  • Page 41 Cycles 5 à 25 ou cycles 8 à 25, selon la trousse. Intensité et densité des amplifiats Du cycle 26 jusqu’à la fin de l’analyse, pour Intensité, densité des amplifiats, % passant le toutes les trousses. filtre, rendement et scores de qualité Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 42: Réalisation D'un Lavage Après Analyse

    Réalisation d’un lavage après analyse Le lavage après analyse est le lavage standard de l’instrument réalisé entre les analyses de séquençage. Procédez toujours au lavage de lʼinstrument après une analyse de séquençage. Suivez les indications du logiciel pour charger les composants de lavage et réaliser le lavage.
  • Page 43 Relevez la poignée des dispositifs d’aspiration du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx et du flacon à déchets jusqu’à ce qu’elle se verrouille. Retirez le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx et remplacez-le par le flacon de lavage. REMARQUE Jetez le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx après chaque analyse. Ne réutilisez pas le reste de la solution SBS (PR2) MiSeqDx.
  • Page 44 L’insertion du tube à une autre position pourrait entraîner l’échec de la génération d’amplifiats lors des analyses suivantes et endommager le système fluidique de l’instrument MiSeqDx. Une fois l’analyse terminée, sélectionnez Start Wash (Démarrer le lavage). Le logiciel lève automatiquement les dispositifs d’aspiration dans le réfrigérant pour réactifs.
  • Page 45 Les dispositifs d’aspiration restent en position basse, ce qui est normal. Laissez la solution de lavage inutilisée sur le plateau de lavage et dans le flacon de lavage, afin d’empêcher les dispositifs d’aspiration de se dessécher et l’air de pénétrer dans le système. Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 46 [Diese Seite wurde absichtlich leer gelassen.] Document  nº 1000000021961 v03  FRA...
  • Page 47: Chapitre 4 Procédures De Maintenance

      Chapitre 4 Procédures de maintenance Procédures de maintenance Fréquence de maintenance Maintenance préventive Réalisation d’un lavage de maintenance Réalisation d’un lavage de mise en veille Arrêt de l’instrument Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 48: Fréquence De Maintenance

    Fréquence de maintenance Effectuez les activités de maintenance décrites dans ce chapitre aux intervalles indiqués dans les tableaux suivants. Tableau 1 Maintenance en fonctionnement normal Activité Quotidienne Mensuelle Au besoin Lavage de maintenance Préparation à Lavage de mise une période en veille d’inactivité...
  • Page 49: Maintenance Préventive

    Illumina recommande d’effectuer une maintenance préventive par année civile. Si vous n’êtes pas lié par un contrat de services, veuillez communiquer avec le responsable commercial de votre zone ou avec l’assistance technique d’Illumina pour organiser un service de maintenance préventive facturable.
  • Page 50: Réalisation D'un Lavage De Maintenance

    Tween 20. Le lavage de maintenance prend environ 90 minutes. L’appareil MiSeqDx peut être configuré pour effectuer un lavage de maintenance, plutôt qu’un lavage après analyse, entre les analyses. Consultez la section Paramétrage de l’option...
  • Page 51 Fermez la porte du réfrigérant pour réactifs. Relevez la poignée des dispositifs d’aspiration située en face du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx et du flacon à déchets jusqu’à ce qu’elle se verrouille, puis remplacez le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx par le flacon de lavage.
  • Page 52 Procédez au lavage final Préparez une nouvelle solution de lavage avec du Tween 20 et de l’eau de laboratoire comme suit : Ajoutez 5 ml de Tween 20 à 100 % dans 45 ml d’eau de laboratoire. Ces volumes permettent d’obtenir du Tween 20 à 10 %. Ajoutez 25 ml de Tween 20 à 10 % dans 475 ml d’eau de laboratoire. Ces volumes permettent d’obtenir une solution de lavage de Tween 20 à...
  • Page 53: Réalisation D'un Lavage De Mise En Veille

    être effectué avant le lancement d’une analyse de séquençage. REMARQUE Illumina recommande d’effectuer un nouveau lavage de mise en veille tous les 30 jours lorsque l’instrument reste inactif. Consommables fournis par l’utilisateur Tween 20 (Sigma-Aldrich, nº de référence P7949)
  • Page 54 Fermez la porte du réfrigérant pour réactifs. Relevez la poignée des dispositifs d’aspiration située en face du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx et du flacon à déchets jusqu’à ce qu’elle se verrouille, puis remplacez le flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx par le flacon de lavage.
  • Page 55 Les dispositifs d’aspiration restent en position basse, ce qui est normal. Laissez la solution de lavage inutilisée sur le plateau de lavage et dans le flacon de lavage, afin d’empêcher les dispositifs d’aspiration de se dessécher et l’air de pénétrer dans le système. Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 56: Arrêt De L'instrument

    Arrêt de l’instrument Il est recommandé de laisser l’instrument allumé en permanence. Toutefois, si vous devez éteindre l’instrument, conformez-vous à la procédure suivante pour arrêter Windows et préparer les lignes fluidiques. Faites un lavage de maintenance. Pour plus de renseignements, consultez la section Procédure, page 44.
  • Page 57: Annexe A Dépannage

    Dépannage en cas d’erreur de débit Réalisation d’un test de volume Résolution des erreurs liées à la température du réfrigérant pour réactifs Résolution des erreurs d’analyse de Local Run Manager Configuration des paramètres du système Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 58: Introduction

    à suivre pour les corriger. En cas de questions techniques, consultez les pages d’assistance du système MiSeqDx sur le site Web d’Illumina pour accéder à la foire aux questions ou connectez-vous à votre compte MyIllumina pour accéder aux bulletins d’assistance.
  • Page 59: Regrouper Des Journaux Pour Le Dépannage

    Regrouper des journaux pour le dépannage La fonctionnalité Bundle Logs (Regrouper des journaux) regroupe des fichiers afin de les envoyer à l’assistance technique d’Illumina pour dépannage. Utilisez l’onglet Bundle Logs (Regrouper des journaux) à l’écran Manage Files (Gérer les fichiers) pour sélectionner un groupe de fichiers, appelé...
  • Page 60: Vérification Du Système

    Certaines vérifications du système peuvent être effectuées avant de communiquer avec l’assistance technique d’Illumina, telles que le test de volume. Ce test permet de vérifier l’état du système fluidique en estimant le volume du flux lorsque des bulles passent au niveau des capteurs.
  • Page 61: Interrompre Ou Arrêter Une Analyse

    Interrompre ou arrêter une analyse L’appareil MiSeqDx est conçu pour effectuer les analyses du début à la fin sans l’intervention de l’utilisateur. Toutefois, il est possible d’interrompre ou d’arrêter une analyse à partir de l’écran Sequencing (Séquençage). Interrompre une analyse Si nécessaire, il est possible d’interrompre une analyse durant le séquençage (par exemple,...
  • Page 62: Relever Manuellement Les Dispositifs D'aspiration De La Cartouche De Réactifs

    Relever manuellement les dispositifs d’aspiration de la cartouche de réactifs Il est possible que les dispositifs d’aspiration de la cartouche de réactifs ne se relèvent pas automatiquement si une analyse est interrompue de manière inattendue ou si une erreur se produit au cours de l’analyse.
  • Page 63: Résolution Des Erreurs De Configuration De Lʼanalyse

    Dispense Rate (Taux de distribution) : 2 500 Sélectionnez Pump (Pomper). Si l’erreur persiste, configurez le volume à pomper sur 500 µl de solution SBS (PR2) MiSeqDx, puis répétez la procédure. Une fois les liquides pompés, sélectionnez Restart Check (Redémarrer la vérification). Si la vérification avant analyse s’effectue correctement, le bouton Start Run (Démarrer l’analyse) est activé.
  • Page 64: Résolution Des Échecs De Lecture Rfid

    Flow Cell. Si la lecture RFID échoue une seconde fois, sélectionnez Get Code (Obtenir un code). Communiquez avec l’assistance technique d’Illumina pour obtenir un code de contournement RFID temporaire. Le code de contournement temporaire expire au bout de sept jours.
  • Page 65 Numéro du code à barres du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx, situé sur l’étiquette du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx, juste sous le code à barres Numéro de référence du flacon de solution SBS (PR2) MiSeqDx Sélectionnez Next (Suivant) pour passer à l’écran Load Reagents (Charger les réactifs).
  • Page 66: Prévention Des Redémarrages Lors D'une Analyse

    Prévention des redémarrages lors d’une analyse Si l’instrument MiSeqDx redémarre au milieu d’une analyse, cela peut signifier que le logiciel Windows Update du réseau est configuré pour installer automatiquement les mises à jour logicielles. (Ce paramètre aurait dû être désactivé lors de l’installation.) Communiquez avec votre service informatique local pour obtenir de l’aide pour désactiver...
  • Page 67: Dépannage En Cas D'erreur De Débit

    Si l’erreur persiste, configurez le volume à pomper sur 500 µl de solution SBS (PR2) MiSeqDx, puis répétez la procédure. Si le deuxième essai ne permet pas de résoudre le problème, communiquer avec l’assistance technique d’Illumina. Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 68: Réalisation D'un Test De Volume

    Réalisation d’un test de volume Une obstruction des lignes fluidiques peut expliquer une mauvaise distribution des réactifs ou de mauvais résultats de séquençage. Si vous pensez que les lignes fluidiques peuvent être obstruées, réalisez un test de volume. Ce test permet de vérifier l’état du système fluidique en estimant le volume entre deux bulles lorsqu’elles passent au niveau des capteurs.
  • Page 69 Résultats du test de volume Si le test nʼest pas concluant, réalisez un lavage de maintenance. Consultez la section Procédure, page 44. À la fin du lavage de maintenance, réalisez à nouveau le test de volume. Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 70: Résolution Des Erreurs Liées À La Température Du Réfrigérant Pour Réactifs

    Si vous voyez un message d’erreur indiquant que la température du réfrigérant ne se trouve pas dans la plage requise, communiquez avec l’assistance technique d’Illumina. Si la température du réfrigérant n’est pas dans la bonne plage, l’analyse de séquençage pourrait ne pas commencer.
  • Page 71: Résolution Des Erreurs D'analyse De Local Run Manager

    Résolution des erreurs d’analyse de Local Run Manager Pour obtenir des renseignements de dépannage associés aux erreurs d’analyse, communiquez avec l’assistance technique d’Illumina. Le Guide de référence du logiciel Local Run Manager pour MiSeqDx (document nº 1000000011880) indique comment remettre une analyse en file d’attente.
  • Page 72: Configuration Des Paramètres Du Système

    MOS comprend deux écrans d’accès aux commandes de configuration du système. Les paramètres du logiciel sont généralement configurés lors de l’installation de l’instrument MiSeqDx. Vous devez posséder le niveau d’accès administrateur pour utiliser cette fonctionnalité. Configuration des paramètres IP et DNS Configurez l’adresse IP et les adresses de serveur DNS si cela est nécessaire en raison d’un...
  • Page 73 écran. Le logiciel est conçu pour être utilisé en mode kiosque. Windows Mode (Mode Windows) : permet d’accéder à Windows sur l’ordinateur de l’instrument. Toute interaction avec l’interface du logiciel, comme l’emplacement des boutons, pourrait être altérée dans ce mode. Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 74 [Diese Seite wurde absichtlich leer gelassen.] Document  nº 1000000021961 v03  FRA...
  • Page 75    Annexe B Dossiers de sortie Dossiers de sortie Dossiers d’analyse Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 76 Dossiers d’analyse Chaque analyse sur le MiSeqDx génère trois dossiers dʼanalyse, chacun dʼeux ayant un objectif précis : D:\Illumina\MiSeqTemp : lorsque lʼanalyse commence, un dossier dʼanalyse temporaire est écrit sur le disque local de lʼordinateur de lʼinstrument et utilisé en tant que zone de travail de MOS et de RTA. Il nʼest pas nécessaire dʼaccéder au dossier Temp (Temporaire).
  • Page 77 42, 47 dénomination 70 paramètres du lavage après temporaire, sortie, analyse 70 durée de l’analyse 21 analyse 13, 17 préparer la mise en veille 47 préparez l’arrêt 50 Guide de référence de l’instrument MiSeqDx avec MOS v2...
  • Page 78 34 antivirus 9 durée de l’analyse 21 initialisation 12 test de volume 62 Local Run Manager 5, 7 MiSeqDx Operating Software (MOS) 5 verrou de la Flow Cell 3 Real-Time Analysis 5 visualiseur d’analyse de séquençage 34 sur instrument 5 vérification de l’espace disque 8...
  • Page 79 0 800 911850 Autres pays +44 1799 534 000 Fiches signalétiques Les fiches signalétiques sont disponibles sur le site Web d’Illumina à l’adresse support.illumina.com/sds.html. Documentation produit De la documentation sur les produits est disponible en format PDF sur le site Web d’Illumina. Accédez au site support.illumina.com, sélectionnez un produit, puis cliquez sur Documentation &...
  • Page 80 Illumina Australia Pty Ltd Nursing Association Building Level 3, 535 Elizabeth Street Melbourne, VIC 3000 Australie Illumina 5200 Illumina Way San Diego, Californie 92122 États-Unis +(1) 800 809 ILMN (4566) Illumina Netherlands B.V. +(1) 858 202 4566 (en dehors de l’Amérique du Nord) Steenoven 19 techsupport@illumina.com...

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