illumina iSeq 100 Manuel Système page 40

Guide du système de séquençage iSeq 100
Run Monitoring and Storage (Surveillance d'analyse et stockage) : envoyer les données de l'analyse à
u
BaseSpace Sequence Hub pour permettre la surveillance et l'analyse à distance (feuille
d'échantillons requise).
3 Saisissez vos identifiants BaseSpace Sequence Hub (adresse courriel et mot de passe), puis sélectionnez
Sign In (Ouverture de session).
4 Si la liste Available Workgroups (Groupes de travail accessibles) s'affiche, sélectionnez un groupe de
travail pour téléverser les données de l'analyse.
La liste s'affiche lorsque vous faites partie de plusieurs groupes de travail.
5 Sélectionnez Run Setup (Configuration de l'analyse).
Saisir les paramètres de l'analyse
1 Dans le champ Run Name (Nom de l'analyse), entrez un nom distinct de votre choix pour l'analyse
en cours.
Le nom de l'analyse peut contenir des caractères alphanumériques, des tirets et des traits de
soulignement.
2 Pour le type de lecture, sélectionnez une des options suivantes :
Single Read (Lecture unique) : exécution d'une seule lecture de séquençage; cette option est la plus
u
rapide et la plus simple.
Paired End (Lecture appariée) : exécution de deux lectures de séquençage; cette option génère des
u
données de meilleure qualité et un alignement plus précis.
3 Dans le champ Read Cycle (Cycle de lecture), saisissez le nombre de cycles à exécuter pour chaque
lecture.
Pour les champs Read 1 (Lecture 1) et Read 2 (Lecture 2), ajoutez un cycle au nombre de cycles
u
voulu.
Pour une analyse comprenant uniquement le contrôle PhiX, saisissez 0 dans les deux champs
u
destinés aux index.
Lecture
Lecture 1
Index 1
Index 2
Lecture 2
Le champ Read 2 (Lecture 2) comporte habituellement la même valeur que le champ Read 1 (Lecture 1),
y compris le cycle supplémentaire. L'index 1 séquence l'adaptateur d'index i7 et l'index 2 séquence
l'adaptateur d'index i5.
4 Pour préciser un dossier de sortie de l'analyse en cours ou téléverser une feuille d'échantillons,
sélectionnez Advanced (Avancé) :
Dans le champ Output Folder (Dossier de sortie), saisissez le chemin pour l'emplacement du dossier
u
de sortie ou sélectionnez Browse (Parcourir) et naviguez jusqu'à l'emplacement voulu.
Dans le champ Sample Sheet (Feuille d'échantillons), saisissez le chemin pour l'emplacement de la
u
feuille d'échantillons ou sélectionnez Browse (Parcourir) pour naviguer jusqu'à l'emplacement voulu.
5 Sélectionnez Start Run (Démarrer l'analyse) pour commencer la vérification avant analyse.
Document nº 1000000036024 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
Nombre de cycles
26 à 151
10 maximum
10 maximum
26 à 151
32