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Guide du système de séquençage iSeq 100
Extraction des intensités
La fonction d'extraction des intensités calcule une valeur d'intensité pour chaque nanopuits dans une
image donnée.
Correction de la mise en phase
Lors de la réaction de séquençage, chaque brin d'ADN dans un amplifiat s'étend d'une base par cycle.
La mise en phase et la mise en préphase ont lieu lorsqu'un brin est déphasé par rapport au cycle
d'incorporation en cours.
La mise en phase se produit lorsqu'un brin a un retard d'une base.
u
La mise en préphase se produit lorsqu'un brin a une avance d'une base.
u
Figure 9 Mise en phase et en préphase
A Lecture avec une base présentant une mise en phase
B Lecture avec une base présentant une mise en préphase
RTA2 corrige les effets de la mise en phase et de la mise en préphase, ce qui maximise la qualité des
données à chaque cycle tout au long de l'analyse.
Définition des bases
La définition des bases détermine une base (A, C, G ou T) pour chaque amplifiat d'une plaque donnée d'un
cycle spécifique. Le système iSeq 100 utilise un séquençage à un seul marqueur qui nécessite un marqueur
et deux images pour encoder les données sur les quatre bases.
Les intensités extraites d'une image et comparées avec une deuxième image donnent quatre populations
distinctes, chacune correspondant à un nucléotide. Le processus de définition des bases détermine à quelle
population appartient chaque amplifiat.
Document nº 1000000036024 v05 FRA
Destiné à la recherche uniquement. Ne pas utiliser à des fins de diagnostic.
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