Principes De Fonctionnement; Positionnement De La Lame; Excitation Du Laser; Numérisation - Agilent G4900DA Manuel De L'utilisateur

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Principes de Fonctionnement

Cette section décrit les fonctionnalités d'utilisation du scanner SureScan.

Positionnement de la lame

Le scanner SureScan peut accueillir jusqu'à 24 lames de 1 pouce  3 dans un panier fixe. Pendant la
numérisation, les lames sont séquentiellement placées en position de numérisation, numérisées, puis
replacées dans le panier. Les lames peuvent être ajoutées et supprimées de la file d'attente du scanner
de manière dynamique sans arrêter le scanner.

Excitation du laser

Le scanner SureScan utilise deux lasers ; un laser à diode fixe verte (532 nm) et un laser à diode rouge
(640 nm). Ces lasers excitent de l'ADN ou de l'ARN marqué à la cyanine 3 (Cy-3) et à la cyanine 5 (Cy-5)
afin de mesurer la fluorescence après hybridation entre l'acide nucléique cible et les sondes du
microréseau. Il est également possible d'utiliser des colorants similaires à la Cy-3 et à la Cy-5 (par
exemple, les colorants Alexa 647, 555 et 660).
Le scanner SureScan est optimisé pour fournir de bonnes performances signal/bruit dans les
bandes d'émission Cy-3 (550 à 610 nm) et Cy-5 (650 à 750 nm). Il combine une large plage
dynamique et une faible diaphonie spectrale, permettant une très large plage de concentrations
cibles et une plus grande fiabilité des données à des niveaux de signal faibles.
Numérisation
Le laser balaie rapidement le microréseau dans les deux sens. La fonction d'autofocus dynamique
garantit le placement systématique du microréseau dans le plan focal de la lentille du laser, et donc
l'uniformité et l'étalonnage de la densité de numérisation.
Détection de fluorescence
Un PMT hautes performances convertit la fluorescence des échantillons marqués en signal
électrique. Des intégrateurs numériques et des amplificateurs de bruit très faible transforment
le signal du PMT en une mesure numérique qui est alors enregistrée dans le fichier TIFF.
Manuel de l'utilisateur du système SureScan
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