Manuels Connexes pour SCM Zeiss LSM 710
Sommaire des Matières pour SCM Zeiss LSM 710
- Page 1 Service Commun de Microscopie MANUEL D’UTILISATION - Précis Microscope Confocal Zeiss LSM 710 Version 3.1 – Précis Novembre 2016...
- Page 3 SERVICE COMMUN DE MICROSCOPIE MANUEL D’UTILISATION Microscope Confocal Zeiss LSM 710 Version 3.1 – Précis Novembre 2016...
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Page 5: Table Des Matières
Sommaire PRESENTATION DU MICROSCOPE ............................... 1 PRESENTATION DU SOFTWARE ..............................3 : ..............................4 ESCRIPTION DES FENETRES PRINCIPALES ’ : ................................. 5 ESTION DE L ESPACE DE TRAVAIL : ....................................5 ES PANNEAUX DEMARRAGE DU MICROSCOPE ..............................6 LA GESTION DES DONNEES ................................. 9 ................................... - Page 6 FIN DE SESSION ..................................73 ....................................73 TAPES INITIALES °1 – S ’ ......................... 75 ROCEDURE DE IN N ANS ARRET DE L EQUIPEMENT °2 – A ’ ........................76 ROCEDURE DE IN N RRET COMPLET DE L EQUIPEMENT PROCEDURES EN CAS D’INCIDENT ............................78 –...
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Page 9: Presentation Du Microscope
Ecran tactile Banc lasers Ordinateur Statif du microscope Le microscope confocal Zeiss LSM 710 est monté sur un statif d’épifluorescence droit Axioimager Z1 (voir Photo(s) 1 p.1 – E). Ce statif est composé : De 2 sources de lumière ... - Page 10 Présentation du microscope Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Ce microscope n’est pas équipé de caméra CCD puisqu’il n’est pas destiné à faire d’acquisitions en épifluorescence classique. Pour transformer ce statif en microscope confocal il a fallu rajouter : ...
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Page 11: Presentation Du Software
Présentation du software Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Présentation du software Le logiciel Zen black de Zeiss pilote ce microscope. L’ensemble des opérations de contrôles du microscope pourra se faire directement dans le logiciel. Copie d'écran 1 : Fenêtre Copie d'écran 2 : Fenêtre 1 en mode «... -
Page 12: Description Des Fenetres Principales
Présentation du software Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Le logiciel LSM Zen se décompose de la façon suivante : une barre de menu 3 fenêtres principales Voir page précédente une barre d’activité Description des fenêtres principales : La fenêtre de gauche... -
Page 13: Estion De Lespace De Travail
Présentation du software Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Gestion de l’espace de travail : Chaque utilisateur peut réorganiser l’espace de travail comme il le souhaite. Il est donc possible de se retrouver avec une organisation des fenêtres qui ne corresponde pas à vos attentes. Pour rétablir l’affichage standard : 1. -
Page 14: Demarrage Du Microscope
Démarrage du microscope Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Démarrage du microscope 11 12 13 14 Photo(s) 2 : Etape de démarrage du microscope Les numéros indiqués sur la photo ci-dessus correspondent aux numéros de la liste qui suit (1 à 16 / A et B). - Page 15 Démarrage du microscope Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 4. Vérifiez que les 2 boitiers au-dessus du statif (sur l’étagère) sont bien allumés. Si un ou les deux boitiers sont éteints, les allumer maintenant. Information Complémentaire :...
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Page 16: Photo(S) 4 : Démarrage Laser Argon
Démarrage du microscope Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis !. Ne touchez pas à l’interrupteur noté « Ne pas toucher ». a. Tournez la clé sur « I ». b. Sur la télécommande posée à droite de l’alimentation mettez le switch sur la position «... -
Page 17: La Gestion Des Donnees
SUPPRIMEES AUTOMATIQUEMENT. En fin de session Transférez vos images dans VOTRE dossier personnel sur le serveur de stockage du SCM. Pour accéder au serveur de stockage double-cliquez sur le raccourci « SCMRAID » présent sur le bureau de l’ordinateur. - Page 18 Précis A NE PAS FAIRE : NE BRANCHEZ JAMAIS DE PERIPHERIQUE SUR LES ORDINATEURS DU SCM (Pas de clé USB, Disques durs externes…). Pour ne pas ralentir ou bloquer le serveur : N’OUVREZ JAMAIS VOS IMAGES A PARTIR DU SERVEUR.
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Page 19: Consignes De Securite
Consignes de Sécurité Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Consignes de Sécurité ATTENTION IMPORTANT RESCPECTEZ CES CONSIGNES DE SECURITE LE NON RESPECT DE CES CONSIGNES PEUT CAUSER DES BLESSURES ET DES DOMMAGES IRREVERSIBLES AU NIVEAU DE VOS YEUX OU CEUX DES PERSONNES PRESENTES DANS LA PIECE Le non-respect des consignes de sécurité... -
Page 20: Deroulement D'une Session
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Déroulement d’une session Démarrage du logiciel 1. Lancez le logiciel de pilotage en double cliquant sur l’icône « ZEN » (en haut à gauche du bureau de l’ordinateur). -
Page 21: Initiation Pilotage/Manipulation Du Microscope
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Initiation pilotage/manipulation du microscope Il existe 3 façons de piloter et manipuler le microscope : : Depuis le logiciel dans l’onglet « Locate » / : Depuis l’écran tactile / : Directement sur le statif. -
Page 22: Ce Que Vous Pouvez Faire Sur L'ecran Tactile
Ce que vous pouvez faire sur l’Ecran Tactile Pour accéder aux fonctions de pilotage sur l’’écran tactile (voir Photo(s) 1 : Vue d’ensemble du microscope confocal Zeiss LSM 710 – p.1 – appuyez tout d’abord sur l’icône « Microscope »... -
Page 23: Ce Que Vous Pouvez Faire Sur Le Microscope
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Ce que vous pouvez faire sur le microscope Photo(s) 9 : Vues statif Légende : Ouverture/Fermeture shutter lampe fluo Vis macrométrique Changement de cube de fluorescence (tourne dans le sens 1) Vis micrométrique... -
Page 24: Photo(S) 10 : Utilisation Joystick
Le déplacement en x et y de la platine s’effectue avec le joystick x/y posé à droite du statif (voir Photo(s) 1 : Vue d’ensemble du microscope confocal Zeiss LSM 710 – p.1 – Icône F) Plus vous éloignez le manche du centre, plus le déplacement de la platine est rapide. De plus, vous pouvez basculer de la gamme de vitesses rapides à... - Page 25 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Attention : Si vous constatez que la platine ne se déplace pas lorsque vous actionnez le joystick, vérifiez que vous n’êtes pas en mode « lent ». Pour cela, appuyez simplement sur la touche au sommet du manche et réessayez de déplacer la platine.
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Page 26: Verification Du Microscope
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Vérification du Microscope RAPPEL : Mettez-vous en mode « Locate » avant de passer mains ou objet dans la zone noire de la platine. Avant de commencer vos acquisitions, vérifiez l’état du microscope. -
Page 27: Nstallation De Lechantillon
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Installation de l’échantillon RAPPEL : Mettez-vous en mode « Locate » avant de passer mains ou objet dans la zone noire de la platine. Avant de sortir vos échantillons, allumez une ou des lampes de bureau et éteignez l’éclairage principal de la pièce. -
Page 28: Photo(S) 14 : Vérification Porte Objet
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 3. Descendez manuellement la position de focus en tournant la vis de mise au point macrométrique droite vers vous de telle sorte que la platine soit clairement plus basse que l’objectif (3 à 4 tours suffisent la plupart du temps). -
Page 29: Photo(S) 16 : Mise En Place Du Porte Objet
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Retirez complètement le porte-objet de la platine en veillant à ne JAMAIS toucher les objectifs avec le porte-objet. Tenez le porte-objet avec les 2 mains : La main gauche tenant le côté gauche en bas et la main droite tenant le côté... -
Page 30: Photo(S) 17 : Dépôt Milieu D'immersion
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Tirez doucement le porte objet vers vous en le faisant glisser sur le rail jusqu’en butée. Zoom > ATTENTION / A NE PAS FAIRE : Tirez très délicatement le porte-objet vers vous. -
Page 31: Photo(S) 18 : Mise En Place De La Lame
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis > > Photo(s) 18 : Mise en place de la lame 10. Si cela n’est pas déjà fait, coupez l’éclairage principal de la pièce. 11. Allumez la lampe halogène et réglez l’intensité de façon à visualiser un spot de lumière 12. -
Page 32: Realisation De La Mise Au Point
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Réalisation de la mise au point Vous devez être en mode « Locate » (voir Installation de l’échantillon – p.19 – Etape 1) Pour faire la mise au point en fluorescence : 1. -
Page 33: Pour Faire La Mise Au Point En Lumière Blanche
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 7. Regardez si vous le souhaitez les autres fluorochromes en changeant le cube de fluorescence 8. Coupez le shutter A savoir / Notez-bien : D’une manière générale, pensez à couper dès que possible la lumière d’excitation fluo en fermant le shutter pour éviter de photoblanchir votre échantillon. -
Page 34: Realisation De La Configuration Confocale
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Réalisation de la configuration confocale Afin comprendre plus facilement la procédure de configuration du trajet optique en mode confocal, nous utiliserons un exemple concret. Description de l’exemple Pour réaliser la configuration confocal nous nous appuierons sur l’échantillon suivant intitulé... -
Page 35: Copie D'écran 10 : Spectres Des Fluorochromes
Valeur du Pic d’émission (nm) … … … Disponible en téléchargement sur le site du SCM à la rubrique « Documentation » (Tableau configuration Fluorochromes) Pour notre exemple nous avons : Fluorochrome(s) Valeur du Pic d’excitation (nm) Valeur du Pic d’émission (nm) -
Page 36: Configuration Du Trajet Optique En Mode Confocal
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Configuration du trajet optique en mode confocal 1. Cliquez sur l’onglet acquisition (voir Copie d'écran 4 : Logiciel LSM Zen – p.3 – Fenêtre 1 – Zone Onglets) 2. -
Page 37: Copie D'écran 14 : Sélection Des Fluorochromes (2)
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Vous pouvez changer les couleurs proposées en cliquant sur la petite flèche sous la colonne « Color » (voir Copie d'écran 11 : Fenêtre "Smart Setup" – ci-dessus – Zone A) ... - Page 38 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Légende : Intensité du signal pour chaque fluorochrome Pourcentage de fuite spectrale (cross talk) – La loupe pointe sur le passage du fluorochrome bleu dans le canal vert.
- Page 39 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Inconvénient de cette solution : Dans certaines conditions, des fuites spectrales peuvent être observées. Attention : N’utilisez pas la solution « Smartest » de façon systématique. Des fuites spectrales peuvent être observées avec cette solution.
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Page 40: Copie D'écran 16 : Panneau "Imaging Setup
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Le panneau « Imaging Setup » Le panneau se situe dans la de la fenêtre 1 en mode « Acquisition », colonne « a » et zone «... -
Page 41: A Quoi Servent Les Différents Éléments Du Trajet Optique
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Dans la Copie d'écran 16 : Panneau "Imaging Setup" : La zone D représente le trajet optique mis en place uniquement pour la track sélectionnée en zone C (track mise en surbrillance : ici track 1). -
Page 42: A Quoi Sert Le « Frame Fast
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis - Indique le cube de fluorescence en place. Il faut donc s’assurer ici que cette icône soit sur « None LSM » pour laisser passer librement le laser. -
Page 43: Copie D'écran 18 : Fenêtre Info "Frame Fast
Toutes tracks confondues Visible light Invisible light Disponible en téléchargement sur le site du SCM à la rubrique « Documentation » (Tableau Bilan Track – Microscope Confocal 2 – Zeiss LSM 710). | Version 3.1 Service Commun de Microscopie... -
Page 44: Copie D'écran 19 : Miroirs Dichroïques - Voie Visible
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Pour notre l’explemple nous avons : Track 1 Track 2 Track 3 Toutes tracks confondues 488 nm 561 nm 488nm, 561 nm Visible light 405 nm 405 nm... - Page 45 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Pour notre exemple nous devons donc mettre en place un miroir dichroïque capable de réfléchir 405. Nous choisissons donc le miroir suivant : 12. Vérifiez que les miroirs que vous avez mis en place dans la track 1 sont bien présents dans les autres tracks.
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Page 46: Enregistrement Et Rappel De Configuration
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Enregistrement et rappel de configuration Enregistrement de configuration Si vous le souhaitez, vous pouvez enregistrer la configuration du trajet optique. Pour cela : 1. Dans la zone « Experiment Manager »... -
Page 47: Copie D'écran 24 : Choix D'une Configuration Enregistrée
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 2. Choisissez votre configuration : Copie d'écran 24 : Choix d'une configuration enregistrée 3. La configuration se recharge alors (Trajet optique + objectif). Attention : Lors du rappel d’une configuration selon cette méthode, le trajet optique et l’objectif utilisés au moment de l’enregistrement sont restaurés. -
Page 48: Reglage Des Parametres Dacquisition
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Réglage des paramètres d’acquisition Les différents réglages des paramètres d’acquisition sont accessibles dans la fenêtre 1 en mode « Acquisition », colonne b (voir Copie d'écran 2 : Fenêtre 1 en mode « Acquisition » - p.3 – colonne b) Vous trouverez dans cette fenêtre 2 panneaux importants :... -
Page 49: Copie D'écran 26 : Vérification Objectif - Panneau "Acquisition Mode
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Réglage du panneau « Acquisition Mode » Toutes les valeurs indiquées dans la suite de la procédure sont données à titre indicatif. Elle constitue un bon point de départ pour commencer à... -
Page 50: Copie D'écran 27 : Zone "Speed" - Panneau "Acquisition Mode
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 4. Cliquez sur l’icône C pour définir la résolution optimale dans la zone D (« Frame Size »). Vous voyez maintenant en zone D le nombre de points à faire en x et en y pour récupérer toute l’information qu’est capable de délivrer l’objectif. - Page 51 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Le bas de la zone F (« Speed ») indique le temps passé par pixel (Pixel Dwell) et le temps passé pour un scan complet (Scan time) incluant toutes les tracks (voir Copie d'écran 27 : Zone "Speed"...
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Page 52: Copie D'écran 28 : "Scan Area" - Panneau "Acquisition Mode
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 12. Dans la zone K , choisissez la direction de scan : --> = Aller simple (le plus précis). <--> = Aller-Retour (le plus rapide). Par défaut vous pouvez choisir « Aller-Retour »... -
Page 53: Le Panneau « Channels
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Le panneau « Channels » Ce panneau va vous permettre de régler les paramètres concernant les différentes channels. Copie d'écran 29 : Panneau "Channels" Légende : Sélection des tracks Réglage du pourcentage de transmission du laser... -
Page 54: Copie D'écran 30 : Sélection Track - Panneau "Channels
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Pour sélectionnez une track, cliquez simplement sur la track de votre choix dans la zone A . La zone B se met alors à jour et vous montre les paramètres concernant la track sélectionnée. - Page 55 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Si l’on mesure l’intensité le long de la ligne tracée ci-dessous on obtient le profil d’intensité suivant : Mesure de l’intensité le long de la ligne Profil d’intensité...
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Page 56: Copie D'écran 32 : Vérification Taille Du Pinhole - Panneau « Channels
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 4. Sélectionnez les autres track puis vérifiez la taille des pinholes (Voir zone E et cadre bleu ci-dessous). Copie d'écran 32 : Vérification taille du Pinhole – Panneau « Channels »... -
Page 57: Copie D'écran 33: Icônes "Experiment Manager
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Il reste maintenant 2 paramètres à ajuster : Le Gain (Master) et le Digital Offset. Plus précisément : Dans la section Réglage du panneau « Acquisition Mode » - p.41 – Etape 11, nous avons réglé la dynamique du capteur sur 8 bit. -
Page 58: Copie D'écran 34 : Fenêtre 2 - Zone "Image
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Le logiciel affiche maintenant dans la fenêtre 2 une image de l’échantillon. (voir Copie d'écran 4 : Logiciel LSM Zen – p.3) Copie d'écran 34 : Fenêtre 2 - Zone "Image"... -
Page 59: Copie D'écran 36 : Range Indicator
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Il faut maintenant affiner le réglage du « Gain (Master) » et du « Digital Offset ». Pour cela il faut un retour visuel en live de l’image. L’image live se met à jour en boucle. En jouant sur un paramètre on voit donc directement comment cela agit sur l’image. -
Page 60: Copie D'écran 37 : Recherche Du Z Le Plus Intense
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Une fois le « Range Indicator » activé, vous voyez en bleu les pixels dans l’offset (considérés comme nuls sur l’image finale) et en rouge les pixels à saturation. -
Page 61: Copie D'écran 39 : Valeurs De "Gain (Master)" Avant Ajustement
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Vous avez 3 solutions pour ajuster le « Gain (Master) » : - Utilisez les flèches haute et basse à droite de la valeur numérique du gain (ajustement précis). -
Page 62: Copie D'écran 41 : Ajustement "Digital Offset
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis de dépasser 2% - Zone C du panneau « Channel »). L’augmentation du pourcentage de transmission vous permettra de diminuer la valeur de gain. A l’inverse, s’il vous faut mettre un gain inférieur à 400 pour n’avoir que quelques pixels rouges, vous pouvez diminuer le pourcentage de transmission du laser correspondant à... -
Page 63: Copie D'écran 42 : Barre D'icônes - Zone "Experiment Manager
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Les icônes de la barre suivante changent de forme en fonction de leur état : Copie d'écran 42 : Barre d'icônes - Zone "Experiment Manager" (voir Copie d'écran 2 : Fenêtre 1 en mode « Acquisition » - p.3 – colonne a) Les icônes... -
Page 64: Images
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Acquisition et enregistrement d’images Acquisition d’images simples (uniquement le plan focal) L’acquisition d’images simples permet d’acquérir uniquement l’information provenant du plan focal actuellement visible sur le microscope. Pour acquérir ce type d’images, suivez la procédure suivante : ATTENTION : Toutes les opérations d’installation de l’échantillon, de mise au point, de configuration du trajet... -
Page 65: Acquisition De Z-Stacks (Piles D'images En Z)
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Pendant l’acquisition, la barre d’activité (en bas de la fenêtre du logiciel - Copie d'écran 4 : Logiciel LSM Zen – p.3 – Zone B affiche une barre de progression. Cette barre vous indique l’avancement de l’acquisition. -
Page 66: Copie D'écran 46 : Panneau "Z-Stack
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Copie d'écran 46 : Panneau "Z-Stack" 3. Activez la case « Show All » si elle n’est pas déjà activée. 4. Cliquez sur l’option « First/Last »... -
Page 67: Copie D'écran 47 : Panneau "Auto Save
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Copie d'écran 47 : Panneau "Auto Save" b. Vérifiez que la case « Auto Save » est bien décochée. 12. Dans la zone « Experiment Manager »... -
Page 68: Enregistrement Des Images
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Enregistrement des images Les images acquises s’affichent en miniatures dans la fenêtre 3 du logiciel (voir Copie d'écran 4 : Logiciel LSM Zen – p.3 – Fenêtre 3) Copie d'écran 49 : Fenêtre 3 - Image non sauvegardée... -
Page 69: Copie D'écran 51 : Fenêtre "Save As
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Copie d'écran 51 : Fenêtre "Save As" 4. Cliquez sur « Computer » puis double-cliquez sur le disque de stockage local D:/ (indiqué par l’étiquette jaune sur l’écran) Le disque D:/ s’ouvre :... -
Page 70: Copie D'écran 53 : Création Nouveau Dossier
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 5. Sélectionnez votre dossier personnel local. 6. Dans votre dossier personnel local, créez-vous un nouveau dossier pour la session en cours. Faites un clic-droit sur une zone vide puis sélectionnez : New > Folder. -
Page 71: Copie D'écran 55 : Image Enregistrée
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 9. Une fois dans votre dossier, nommez votre image dans la zone « File name » (en bas de la fenêtre) – Zone A avec le nom de votre choix. -
Page 72: Explorer Ses Images
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Explorer ses images Une fois vos images acquises et enregistrées vous pouvez les explorer. Copie d'écran 56 : Logiciel LSM Zen (2) Introduction Si vous souhaitez observer une image qui n’est pas présente dans la zone d’image double-cliquez sur une image présente dans la fenêtre... -
Page 73: Les Icônes « Images
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Les icônes « Images » A gauche de chaque image, vous trouverez une série d’icônes qui vous permettra d’explorer de différentes façons votre image. Icônes Condition de présence... -
Page 74: Les Outils Complémentaires
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Les outils complémentaires En bas de la zone image vous trouverez une série d’outils (voir Copie d'écran 56 : Logiciel LSM Zen (2) – p.64 – Fenêtre 2) complémentaires. -
Page 75: Copie D'écran 60 : Onglet "Display
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Cet onglet permet : de naviguer dans vos expériences multi-paramétriques : d’accéder à des fonctions de zoom post-acquisition : d’activer ou masquer des canaux et changer leur couleur d’affichage : Cliquez sur une icône de ce type :... -
Page 76: Copie D'écran 61 : Onglet "Player
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis L’onglet « Player » Copie d'écran 61 : Onglet "Player" Cet onglet permet : de faire défiler les images qui composent une expérience multi-paramétriques. Pour intervenir sur le défilement, utilisez les icônes suivantes :... -
Page 77: Changer D'objectif Au Cours De La Session
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Changer d’objectif au cours de la session Si vous souhaitez changer d’objectif pendant la session, suivez la procédure suivante : Passage d’un objectif sec à un autre objectif sec 1. - Page 78 Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 3. Appuyez sur la touche « Load Position » sur la droite du statif pour descendre la platine (voir Initiation pilotage/manipulation du microscope p.13) 4. Descendez au maximum la platine en appuyant et maintenant appuyé, jusqu’à l’arrêt, la touche « Load position »...
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Page 79: Changer De Lame Au Cours De La Session
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Changer de lame au cours de la session Si vous souhaitez changer de lame au cours de la session suivez la procédure suivante : Si vous êtes sur un objectif sec 1. -
Page 80: Rappel Des Parametres Dacquisition Dune Image
Déroulement d’une session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Rappel des paramètres d’acquisition d’une image Nous avons déjà vu au chapitre « Enregistrement et rappel de configuration » p.38 comment rappeler une configuration de trajet optique confocal. Cette technique permet de remettre en place rapidement le trajet optique enregistré... -
Page 81: Fin De Session
Fin de session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Fin de session Veuillez à respecter vos horaires de sessions. Pensez à garder du temps en fin de session pour réaliser les étapes de récupération des échantillons, nettoyage et arrêt de l’équipement si besoin. -
Page 82: Copie D'écran 63 : Planning De Réservation
Fin de session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 5. Fermez les fenêtres du dossier local et serveur. 6. Vérifiez le planning de réservation en double-cliquant sur l’icône « Planning » Le planning de la semaine en cours s’ouvre. -
Page 83: Ans Arret De Lequipement
Fin de session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Procédure de Fin n°1 – Sans arrêt de l’équipement Cette procédure est à suivre uniquement si : Il y a un utilisateur juste après vous. Il y a 1, 2 ou 3 heures de libre entre vous et l’utilisateur suivant. -
Page 84: Procédure De Fin N°2 - Arrêt Complet De L'équipement
Fin de session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Procédure de Fin n°2 – Arrêt complet de l’équipement Cette procédure est à suivre uniquement dans l’un des cas suivants : Il y a 4 heures ou plus de libre entre vous et l’utilisateur suivant. - Page 85 Fin de session Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis 8. Si vous étiez sur un objectif à immersion, nettoyez soigneusement l’objectif (sinon passez directement à l’étape 8) : a. Prenez un papier optique et pliez-le en 4.
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Page 86: Procedures En Cas D'incident
En cas de problème dans une pièce Si vous constatez une anomalie dans une pièce du SCM (fuite d’eau, coupure d’électricité…) contactez immédiatement l’atelier (Service Technique) du site et décrivez le problème. En cas de besoin, insistez sur le caractère urgent d’une intervention ; si par exemple de l’eau menace de tomber sur un microscope. -
Page 87: Rocedure En Cas Dincident Equipement
Si vous ne trouvez personne pour résoudre le problème : Si personne ne peut vous aider, merci de remplir le formulaire « Incident Microscope » disponible sur le site du SCM à l’adresse suivante : http://www.biomedicale.univ-paris5.fr/scm/formulaire_incident_equipement Vous pouvez accéder directement à ce formulaire en double cliquant sur le lien présent sur chaque bureau d’ordinateur de la Plate-Forme. -
Page 88: Table Des Illustrations
Table des illustrations page suivante Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Table des illustrations page suivante Version 3.1 | Service Commun de Microscopie... -
Page 89: Copies D ' Ecran
Table des illustrations Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Table des illustrations Copies d’écran Copie d'écran 1 : Fenêtre 1 en mode « Locate » ......................3 Copie d'écran 2 : Fenêtre 1 en mode « Acquisition » ....................... 3 Copie d'écran 3 : Fenêtre 1 en mode «... - Page 90 Copie d'écran 63 : Planning de réservation ........................74 Photos Photo(s) 1 : Vue d’ensemble du microscope confocal Zeiss LSM 710 ................1 Photo(s) 2 : Etape de démarrage du microscope ......................6 Photo(s) 3 : Remote control .............................. 6 Photo(s) 4 : Démarrage Laser Argon ..........................
- Page 91 Table des illustrations Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Photo(s) 19 : Approche de l'objectif ..........................23 Photo(s) 20 : Ecran de protection ........................... 24 Photo(s) 21 : Mise au point ............................. 24 Photo(s) 22 : Réticule de visée ............................24 Photo(s) 23 : Arrêt Laser Argon ............................
- Page 92 Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Version 3.1 | Service Commun de Microscopie...
- Page 93 Manuel d’Utilisation – Microscope Confocal Zeiss LSM 710 – Précis Pour toute remarque ou suggestion concernant ce guide merci d’envoyer un e-mail à l’adresse suivante : scm@parisdescartes.fr | Version 3.1 Service Commun de Microscopie...